Pithovirus

Vikipediya, ochiq ensiklopediya

Pitovirus, birinchi marta 2014-yilgi maqolada tasvirlangan, ikki turdagi Pithovirus sibericumdan maʼlum boʻlgan gigant virus turi boʻlib, amyobalarni[1][2]va Pithovirus massiliensisni yuqtiradi[3]. Bu ikki zanjirli DNK virusi boʻlib, nukleotsitoplazmatik yirik DNK viruslari guruhining aʼzosi hisoblanadi. 2014-yilda kashfiyot Rossiyaning Sibirdagi abadiy muzligidan olingan 30 000 yillik muz yadrosida yashovchan namuna topilganida qilingan.

Tavsifi[tahrir | manbasini tahrirlash]

Yangi turni tasvirlash uchun qadimgi Yunonistonning pithoi deb nomlanuvchi katta saqlash idishlariga ishora qiluvchi Pithovirus jinsi tanlangan. Pitovirus namunasi taxminan 1,5 oʻlchamga ega mkm (1500 nm) uzunligi va 0,5 mkm (500 nm) diametri boʻlib, u hali topilgan eng katta virusga aylanadi. U avvalgi eng yirik viruslar boʻlgan Pandoraviridaedan 50 % kattaroqdir[4]va eng kichik eukaryotik hujayra boʻlgan Ostreokokkdan kattaroqdir, garchi Pandoravirus 1,9-2,5 megabaza DNKni oʻz ichiga olgan eng katta virus genomiga ega[5].

Pitovirus qalin, oval devorga ega, bir uchida teshik bor. Ichkarida, uning tuzilishi asal chuquriga oʻxshaydi[6].

Pitovirus genomida 467 ta alohida gen mavjud boʻlib, bu odatiy virusdan koʻproq, ammo Pandoravirusda topilgan 2556 taxminiy protein kodlash ketma-ketligidan ancha kam[7]. Shunday qilib, uning genomi boshqa maʼlum viruslarga qaraganda ancha kamroq zich joylashgan. Uning oqsillarining uchdan ikki qismi boshqa viruslarnikidan farq qiladi. Pandoravirus bilan jismoniy oʻxshashligiga qaramay, Pitovirus genom ketma-ketligi uning ushbu virus bilan deyarli bogʻliq emasligini koʻrsatadi, lekin Marseilleviridae, Megaviridae va Iridoviridae vakillariga yaqinroq oʻxshaydi[8]. Bu oilalarning barchasida DNK genomlari boʻlgan yirik ikozahedral viruslar mavjud. Pitovirus genomida pandoraviruslar uchun 61 % dan farqli oʻlaroq, Megaviridaega oʻxshash 36 % GC tarkibi.

Replikatsiya[tahrir | manbasini tahrirlash]

Pitovirus genomi 610 000 ta asosiy juftlikdan (bp) iborat bitta dumaloq, ikki zanjirli DNK (dsDNA) xromosomasi boʻlib, taxminan 467 ta ochiq oʻqish ramkalarini (ORF) kodlaydi, ular 467 xil oqsilga aylanadi[9]. Genom mRNK ishlab chiqarish uchun zarur boʻlgan barcha oqsillarni kodlaydi, bu oqsillar tozalangan virionlarda mavjud[10]. Shunday qilib, pitovirus xost yadrosini egallashning odatiy usuli emas, balki butun replikatsiya siklini xost sitoplazmasida oʻtkazadi[11][12][13].

Kashfiyoti[tahrir | manbasini tahrirlash]

Pithovirus sibericum Eks-Marsel universitetidan Chantal Abergel va Jan-Mishel Klaveri tomonidan 30 000 yillik Sibir abadiy muzligi namunasida topilgan[11][14]. Virus koʻmilgan 30 m (100 ft) kishi aniqlandi kechki pleystotsen choʻkindisi yuzasi ostida[15][12]. 2000-yilda toʻplangan daryo qirgʻogʻi namunalari amyobalarga taʼsir qilganda topilgan[16]. Amyobalar oʻlishni boshladilar va tekshirilganda gigant virus namunalari borligi aniqlandi. Mualliflarning taʼkidlashicha, ular ikki yil avval Silene stenophylla urugʻini qayta tiklagan tajriba haqida oʻqib, yangi viruslar uchun abadiy muzlik namunalarini tekshirish gʻoyasiga ega boʻlishgan[11]. Pitovirus topilmalari 2014-yil mart oyida Milliy Fanlar Akademiyasi materiallarida chop etilgan[17][18]. Virus odamlar uchun zararsiz boʻlsa-da, ming yillar davomida muzlatilganidan keyin uning yashovchanligi global iqlim o'zgarishi va tundrani burgʻulash ishlari ilgari kashf etilmagan va potentsial patogen viruslarning topilishiga olib kelishi mumkinligi haqida xavotirlarni uygʻotdi[17]. Biroq, boshqa olimlar bu stsenariy haqiqiy xavf tugʻdirishi haqida bahslashmoqda[11].

Pithovirus massiliensis jinsidagi zamonaviy tur 2016-yilda ajratilgan. ORF va etim genlar (ORFans) tartibi kabi asosiy xususiyatlar ikki maʼlum tur oʻrtasida yaxshi saqlanib qolgan[19].

Evolyutsiyasi[tahrir | manbasini tahrirlash]

Genomning mutatsiyasining tezligi yiliga 2,23 × 10 -6 almashtirish / sayt / yil deb taxmin qilingan[20]. Mualliflar bu viruslar kamida yuz minglab yillar oldin paydo boʻlgan deb taxmin qilishdi.

Manbalar[tahrir | manbasini tahrirlash]

  1. ↑ Yong, Ed (3 March 2014). "Giant virus resurrected from 69,000-year-old ice". Nature. doi:10.1038/nature.2014.14801. 
  2. ↑ Morelle, Rebecca. „30,000-year-old giant virus 'comes back to life'“. BBC News (2014-yil 3-mart).
  3. ↑ "Comparison of a modern and fossil Pithovirus reveals its genetic conservation and evolution". Genome Biol Evol 8 (8): 2333–9. July 2016. doi:10.1093/gbe/evw153. PMID 27389688. PMC 5010891. //www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?tool=pmcentrez&artid=5010891. 
  4. ↑ Sirucek, Stefan. „Ancient "Giant Virus" Revived From Siberian Permafrost“. National Geographic (2014-yil 3-mart).
  5. ↑ Brumfiel, Geoff. „World's Biggest Virus May Have Ancient Roots“. National Public Radio (2013-yil 18-iyul).
  6. ↑ Yong, Ed (3 March 2014). "Giant virus resurrected from 69,000-year-old ice". Nature. doi:10.1038/nature.2014.14801. 
  7. ↑ Sirucek, Stefan. „Ancient "Giant Virus" Revived From Siberian Permafrost“. National Geographic (2014-yil 3-mart).
  8. ↑ Racaniello, Vincent. „Pithovirus: Bigger than Pandoravirus with a smaller genome“ (2014-yil 4-mart).
  9. ↑ „Pithovirus sibericum“. Swiss Institute of Bioinformatics (SIB). Qaraldi: 2014-yil 10-mart.
  10. ↑ Racaniello, Vincent. „Pithovirus: Bigger than Pandoravirus with a smaller genome“. Virology Blog (2014-yil 4-mart).
  11. ↑ 11,0 11,1 11,2 11,3 Yong, Ed (3 March 2014). "Giant virus resurrected from 69,000-year-old ice". Nature. doi:10.1038/nature.2014.14801. Yong, Ed (3 March 2014). „Giant virus resurrected from 69,000-year-old ice“. Nature. doi:10.1038/nature.2014.14801. S2CID 87146458.
  12. ↑ 12,0 12,1 Racaniello, Vincent. „Pithovirus: Bigger than Pandoravirus with a smaller genome“. Virology Blog (2014-yil 4-mart).Racaniello, Vincent (4 March 2014). „Pithovirus: Bigger than Pandoravirus with a smaller genome“. Virology Blog.
  13. ↑ Coghlan, Andy. „Biggest-ever virus revived from Stone Age permafrost“. NewScientist (2014-yil 3-mart). 2014-yil 5-martda asl nusxadan arxivlangan.
  14. ↑ Pappas, Stephanie. „Frozen Giant Virus Still Infectious After 30,000 Years“. Yahoo News (2015-yil 16-sentyabr). Qaraldi: 2015-yil 20-sentyabr.
  15. ↑ Morelle, Rebecca. „30,000-year-old giant virus 'comes back to life'“. BBC News (2014-yil 3-mart).
  16. ↑ Zimmer, Carl. „Out of Siberian Ice, a Virus Revived“. The New York Times (2014-yil 3-mart).
  17. ↑ 17,0 17,1 Sirucek, Stefan. „Ancient "Giant Virus" Revived From Siberian Permafrost“. National Geographic (2014-yil 3-mart).Sirucek, Stefan (3 March 2014). "Ancient „Giant Virus“ Revived From Siberian Permafrost". National Geographic.
  18. ↑ Legendre, M.; Bartoli, J.; Shmakova, L.; Jeudy, S.; Labadie, K.; Adrait, A.; Lescot, M.; Poirot, O. et al. (March 2014). "Thirty-thousand-year-old distant relative of giant icosahedral DNA viruses with a pandoravirus morphology". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111 (11): 4274–9. doi:10.1073/pnas.1320670111. PMID 24591590. PMC 3964051. //www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?tool=pmcentrez&artid=3964051. 
  19. ↑ "Comparison of a modern and fossil Pithovirus reveals its genetic conservation and evolution". Genome Biol Evol 8 (8): 2333–9. July 2016. doi:10.1093/gbe/evw153. PMID 27389688. PMC 5010891. //www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?tool=pmcentrez&artid=5010891. 
  20. ↑ Duchêne, S; Holmes, EC (2018). "Estimating evolutionary rates in giant viruses using ancient genomes". Virus Evol 4 (1): vey006. doi:10.1093/ve/vey006. PMID 29511572. PMC 5829572. //www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?tool=pmcentrez&artid=5829572.  
"https://uz.wikipedia.org/w/index.php?title=Pithovirus&oldid=3104684" dan olindi