Reovirus
Reoviridae - ikki zanjirli RNK viruslari oilasiga mansub. Aʼzo viruslar umurtqalilar, umurtqasizlar, oʻsimliklar, protistlar va qoʻziqorinlarda parazitlik qiladi.[1] Ularda lipid konvertlari yoʻq va ularning segmentlangan genomlari koʻp qatlamli kapsidlar ichida toʻplanadi. Lipid konvertining yoʻqligi bu yirik murakkab viruslarning uch oʻlchovli tuzilmalarini (diametri ~60-100 nm) olishga imkon berdi, bu bakteriofagning sistoviruslar oilasi bilan tizimli va ehtimol evolyutsion aloqalarni ochib berdi.[2] Hozirgi vaqtda bu oilada 97 tur mavjud boʻlib, ular ikkita kichik oilada 15 avlodga boʻlingan.[3] Reoviruslar oshqozon- ichak tizimiga (masalan, rotaviruslar) va nafas olish yoʻllariga taʼsir qilishi mumkin.[4] „Reo-“ nomi "respirator enterik orfan " viruslarining qisqartmasi hisoblanadi .[5] " Yetim virusi " atamasi ushbu viruslarning baʼzilari hech qanday kasallik bilan aloqasi boʻlmagan holatlari kuzatilganligini anglatadi. Reoviridae oilasidagi viruslar yaqinda boshqa kasalliklarda aniqlangan boʻlsa ham, asl nomi hali ham qoʻllanadi.
Reovirus infeksiyalari koʻpincha odamlarda uchraydi, aksariyat hollarda engil yoki subklinikdir. Rotaviruslar bolalarda ogʻir diareya va ichak ogʻrigʻiga olib kelishi mumkin va sichqonlarda oʻtkazilgan laboratoriya tadqiqotlari oldindan joylashtirilgan odamlarda coeliac kasalligining namoyon boʻlishida ortoreoviruslarni aniqladi.[6] Virusni najasda osongina aniqlash mumkin, shuningdek, faringeal yoki burun sekretsiyasi, siydik, miya suyuqligi va qondan aniqlanishi mumkin. Klinik namunalarda reoviruslarni topish juda oson.
Ushbu oilaning baʼzi viruslari, masalan, fitoreoviruslar va oryzaviruslar oʻsimliklarni kasallantiradi. Oʻsimliklarga yuquvchi reoviruslarning aksariyati oʻsimliklar oʻrtasida hasharotlar vektorlari yuqadi. Viruslar oʻsimlikda ham, hasharotlarda ham koʻpayadi, odatda oʻsimlikda kasallik qoʻzgʻatadi, lekin zararlangan hasharotga juda oz yoki umuman zarar etkazmaydi.[7] :148
Tuzilishi
[tahrir | manbasini tahrirlash]Reoviruslar konvertsiz va tashqi (T = 13) va ichki (T = 2) oqsil qobigʻidan tashkil topgan ikoseadr kapsidga ega.[1][8] Ultrastruktura tadqiqotlari shuni koʻrsatadiki, virion kapsidlari avlodga qarab ikki yoki uchta alohida qatlamdan iborat. Eng ichki qavat (yadro) T=1 ikosahedral simmetriyaga ega va 60 xil turdagi strukturaviy oqsillardan tashkil topgan. Yadro genom segmentlarini oʻz ichiga oladi, ularning har biri transkripsiya uchun zarur boʻlgan turli xil ferment tuzilishini kodlaydi. Yadro kapsid qavati T=13 ikosahedral simmetriya bilan qoplangan. Reoviruslar oʻziga xos tuzilishga ega boʻlib, uning yuzasida glikolizatsiyalangan boshoqli oqsil mavjud.[9]
Genom
[tahrir | manbasini tahrirlash]Reoviridae oilasidagi viruslarning genomlari 10-12 segmentni oʻz ichiga oladi, ular oʻzlarining oʻlchamlariga koʻra uchta toifaga birlashtirilgan: L (katta), M (oʻrta) va S (kichik). Segmentlar taxminan 0,2 dan 3 gacha kbp va har bir segment 1-3 oqsilni kodlaydi (jami 10-14 oqsil[1]). Reoviridae oilasidagi viruslar oqsillari u tarjima qilingan segmentga mos keladigan yunoncha belgi bilan belgilanadi (L segmenti l oqsillarini, M segmenti m oqsillarini va S segmenti s oqsillarini kodlaydi).[8]
Hayot davrasi
[tahrir | manbasini tahrirlash]Reoviridae oilasidagi viruslar segmentlangan, ikki zanjirli RNK (dsRNK) dan iborat genomlarga ega.[4] Shu sababli replikatsiya faqat sitoplazmada sodir boʻladi va virus replikatsiya va sRNK genomini ijobiy maʼnoli RNKlarga aylantirish uchun zarur boʻlgan bir nechta oqsillarni kodlaydi.[10]
Virus hujayra yuzasida joylashgan retseptor orqali hujayrasiga kirishi mumkin. Retseptor nomaʼlum, ammo sialik kislota va birikma yopishish molekulalarini (JAM) oʻz ichiga oladi.[10] Virus endolizosomadagi proteazlar bilan qisman qoplanmagan boʻlib, u yerda hujayraning keyingi kirishiga imkon berish uchun kapsid qisman hazm qilinadi. Keyin yadro zarrasi sitoplazmaga hali nomaʼlum jarayon orqali kiradi, bu yerda genom konservativ tarzda transkripsiyalanadi va bu salbiy maʼnoli iplarni sintez qilish uchun messenjer RNK shablonlari sifatida qoʻllanadigan ijobiy maʼnoli zanjirlarning ortiqcha koʻpayishiga olib keladi.[10]
Rotavirusning genomi 11 segmentga boʻlingan. Ushbu segmentlar RNK sintezi uchun mas'ul boʻlgan VP1 molekulasi bilan bogʻliq. Dastlabki hodisalarda 11 xil RNK segmentlarining kirishi hujayraga oʻtishi uchun tanlash jarayoni sodir boʻladi. Ushbu protsedura yangi sintez qilingan RNKlar tomonidan amalga oshiriladi. Bu hodisa 11 xil RNK segmentlarining har birida bittadan olinishini taʼminlaydi. Kechki hodisalarda transkripsiya jarayoni yana sodir boʻladi, lekin bu vaqt dastlabki voqealardan farqli ravishda cheklanmaydi. Virus uchun turli xil miqdordagi RNKlar talab qilinadi, shuning uchun translatsiya bosqichida nazorat mexanizmi mavjud. RNK segmentlarining miqdori bir xil, ammo oqsillarning miqdori har xil. Buning sababi RNK segmentlarining bir xil tezlikda tarjima qilinmasligidir.[7]
Virusli zarralar infeksiyadan 6-7 soat oʻtgach sitoplazmada toʻplana boshlaydi. Tarjima sızıntılı skanerlash, tugatishni bostirish va ribosomalarni oʻtkazib yuborish orqali amalga oshiriladi. Virus mezbon hujayradan monopartitli kanalchasiz boshqariladigan virus harakati, hujayradan hujayraga oʻtishi va hujayra oʻlganidan keyin okklyuzion tanalarda mavjud boʻlib, boshqa xost topgunga qadar yuqumli boʻlib qoladi.[1]
Genus | Host details | Tissue tropism | Entry details | Release details | Replication site | Assembly site | Transmission |
---|---|---|---|---|---|---|---|
Aquareovirus | Aquatic vertebrates: fish; aquatic invertebrates: shellfish; aquatic invertebrates: crustaceans | None | Cell receptor endocytosis | Cell death | Cytoplasm | Cytoplasm | Passive diffusion |
Cardoreovirus | Crustaceans: crabs | None | Cell receptor endocytosis | Cell death | Cytoplasm | Cytoplasm | Arthropod bite |
Coltivirus | Humans; rodents; ticks; mosquitoes | Erythrocytes | Cell receptor endocytosis | Cell death | Cytoplasm | Cytoplasm | Arthropod bite |
Cypovirus | Insects | Midgut; goblet; fat | Cell receptor endocytosis | Cell death | Cytoplasm | Cytoplasm | Polyhedra: oral-fecal; vertical: eggs |
Dinovernavirus | Insects; Mosquitoes | None | Unknown | Cell death | Cytoplasm | Cytoplasm | Unknown |
Fijivirus | Plants: gramineae; plants: liliacea; planthoppers | Phloem | Viral movement; mechanical inoculation | Cell death | Cytoplasm | Cytoplasm | Delphacid plant hoppers |
Idnoreovirus | Hymenoptera | Gut | Cell receptor endocytosis | Cell death | Cytoplasm | Cytoplasm | Unknown |
Mimoreovirus | Algae | None | Cell receptor endocytosis | Cell death | Cytoplasm | Cytoplasm | Arthropod bite |
Mycoreovirus | Fungi | Mycelium | Cell death; cytoplasmic exchange, sporogenesis; hyphal anastomosis | Cell death; cytoplasmic exchange, sporogenesis; hyphal anastomosis | Cytoplasm | Cytoplasm | Cytoplasmic exchange, sporogenesis; hyphal anastomosis |
Orbivirus | Vertebrates; mosquitoes; midges; gnats; sandflies; ticks | None | Cell receptor endocytosis | Cell death | Cytoplasm | Cytoplasm | Arthropod bite |
Orthoreovirus | Vertebrates | Epithelium: intestinal; epithelium:bile duct; epithelium: lung; leukocytes; endothelium: CNS | Clathrin-mediated endocytosis | Cell death | Cytoplasm | Cytoplasm | Aerosol; oral-fecal |
Oryzavirus | Plants: graminae, Oryza sativa; planthoppers | None | Viral movement; mechanical | Cell death | Cytoplasm | Cytoplasm | Delphacid planthoppers |
Phytoreovirus | Oryza sativa; leafhoppers | Phloem | Viral movement; mechanical inoculation | Cell death | Cytoplasm | Cytoplasm | Leafhoppers |
Rotavirus | Humans; vertebrates | Intestinal mucosa | Clathrin-mediated endocytosis | Cell death | Cytoplasm | Cytoplasm | Oral-fecal |
Seadornavirus | Humans; cattle; pigs; mosquitoes | None | Cell receptor endocytosis | Cell death | Cytoplasm | Cytoplasm | Zoonosis; arthropod bite |
Koʻplikni qayta faollashtirish
[tahrir | manbasini tahrirlash]Koʻplikni qayta faollashtirish (MR) — bu ikki yoki undan ortiq virus genomlari, har birida inaktivatsiya qiluvchi genom shikastlanishi mavjud boʻlib, infeksiyalangan hujayra ichida tirik virus genomini hosil qilish uchun oʻzaro taʼsir qilishi mumkin. McClain va Spendlove[11] ultrabinafsha nurlanish taʼsiridan keyin uch turdagi reovirus uchun MRni koʻrsatdi. Ularning tajribalarida reovirus zarralari bitta infeksiyada halokatli boʻlgan ultrabinafsha nurlanish dozalariga taʼsir qilishdi. Biroq, ikki yoki undan koʻp faollashtirilgan viruslarning individual xost hujayralarini yuqtirishiga ruxsat berilganda, MR paydo boʻldi va tirik nasl paydo boʻldi. Ular taʼkidlaganidek, taʼrif boʻyicha koʻplikni qayta faollashtirish qandaydir taʼmirlashni oʻz ichiga oladi. Michod va boshqalar.[12] turli viruslardagi MRning koʻplab misollarini koʻrib chiqdi va MR viruslarda jinsiy oʻzaro taʼsirning keng tarqalgan shakli boʻlib, genom shikastlanishlarini rekombinatsion tiklash foydasini taʼminlaydi.
Taksonomiya
[tahrir | manbasini tahrirlash]Reoviridae oilasi ichki kapsidda „turret“ oqsili mavjudligiga koʻra ikkita kichik oilaga[13] boʻlinadi.[14][15] ICTV kommunikatsiyalaridan: „ Spinareovirinae nomi tikilgan yoki turretli viruslarni oʻz ichiga olgan kichik oilani aniqlash uchun ishlatiladi va“ reovirus" va lotincha „spina“ soʻzidan kelib chiqqan boʻlib, boshoq yoki minoralar mavjudligini bildiruvchi boshoq degan maʼnoni anglatadi. yadro zarralari yuzasida. „Spiked“ atamasi „turreted“ soʻziga muqobil boʻlib, u zarrachaning tuzilishini, xususan, sipoviruslarni tasvirlash uchun dastlabki tadqiqotlarda ishlatilgan. Sedoreovirinae nomi turretlanmagan virus avlodini oʻz ichiga olgan subfamilani aniqlash uchun ishlatiladi va „reovirus“ va lotincha „sedo“ soʻzidan olingan boʻlib, silliq degan maʼnoni anglatadi, bu viruslarning asosiy zarralarida tikanlar yoki minoralar yoʻqligini bildiradi., nisbatan silliq morfologiyaga ega."[16]
Reoviridae oilasi quyidagi kenja oilalar va avlodlarga boʻlinadi: Sedoreovirinae Cardoreovirus Mimoreovirus Orbivirus Phytoreovirus Rotavirus Seadornavirus Spinareovirinae Aquareovirus Coltivirus Cypovirus Dinovernavirus Fijivirus Idnoreovirus Mycoreovirus Orthoreovirus Oryzavirus
Terapevtik ilovalar
[tahrir | manbasini tahrirlash]Odamlarda reoviruslar asosan patogen boʻlmasa-da, bu viruslar virus patogenezini oʻrganish uchun juda samarali eksperimental modellar boʻlib xizmat qildi.[17] Yangi tugʻilgan sichqonlar reovirus infeksiyalariga juda sezgir va reovirus patogenezini oʻrganish uchun afzal qilingan eksperimental tizim sifatida ishlatilgan.[2]
Reoviruslar onkolitik (saratonni oʻldiradigan) xususiyatlarga ega ekanligi isbotlangan, bu saraton kasalligini davolash uchun reovirusga asoslangan davolash usullarini ishlab chiqishni ragʻbatlantiradi.[18][19][20]
Reolizin - bu reovirus (Sutemizuvchilar ortoreovirusi serotipi 3-dearing shtammi[21]) ning formulasi boʻlib, u hozirda turli xil saraton kasalliklarini davolash uchun klinik sinovlarda[22], jumladan, hozirda Reolizinning boshqa immunoterapiyalar bilan birgalikda rolini oʻrganish uchun ishlab chiqilgan tadqiqotlar.[21]
Yana qarang
[tahrir | manbasini tahrirlash]- Ikki zanjirli RNK viruslari
- Onkolitik virus
- Yetim virus1.
- ↑ 1,0 1,1 1,2 1,3 „Viral Zone“. ExPASy. Qaraldi: 15-iyun 2015-yil.
- ↑ 2,0 2,1 Guglielmi, KM; Johnson, EM; Stehle, T; Dermody, TS (2006). „Attachment and Cell Entry of Mammalian Orthoreovirus“. Curr Top Microbiol Immunol. Current Topics in Microbiology and Immunology. 309-jild. 1–38-bet. doi:10.1007/3-540-30773-7_1. ISBN 978-3-540-30772-3. PMID 16909895.
- ↑ „Virus Taxonomy: 2019 Release“. talk.ictvonline.org. International Committee on Taxonomy of Viruses. 2020-yil 20-martda asl nusxadan arxivlangan. Qaraldi: 11-may 2020-yil.
- ↑ Fenner, F (1976-yil iyun). „The classification and nomenclature of viruses. Summary of results of meetings of the International Committee on Taxonomy of Viruses in Madrid, September 1975“. Virology. 71-jild, № 2. 371–8-bet. doi:10.1016/0042-6822 (76)90364-0. PMC 7131526. PMID 820065.
{{cite magazine}}
: Check|doi=
value (yordam); sana kiritilishi kerak boʻlgan parametrga berilgan qiymatni tekshirish lozim:|date=
(yordam) - ↑ Bouziat, R; et al. (7-aprel 2017-yil). „Reovirus infection triggers inflammatory responses to dietary antigens and development of celiac disease“. Science. 356-jild, № 6333. 44–50-bet. Bibcode:2017Sci...356...44B. doi:10.1126/science.aah5298. PMC 5506690. PMID 28386004.
{{cite magazine}}
: CS1 maint: date format () - ↑ 7,0 7,1 Carter, John. Virology: Principles and Applications. West Sussex: Wiley, 2007. ISBN 978-0-470-02386-0.
- ↑ 8,0 8,1 „Reoviruses“. MicrobiologyBytes. 2015-yil 21-mayda asl nusxadan arxivlangan.
- ↑ „Family Reoviridae“. Viruses. 2017. 219–226-bet. doi:10.1016/B978-0-12-803109-4.00026-X. ISBN 9780128031094.
- ↑ 10,0 10,1 10,2 Barton, ES; Forrest, JC; Connolly, JL; Chappell, JD; Liu, Y; Schnell, FJ; Nusrat, A; Parkos, CA; Dermody, TS (9-fevral 2001-yil). „Junction adhesion molecule is a receptor for reovirus“. Cell. 104-jild, № 3. 441–51-bet. doi:10.1016/S0092-8674 (01)00231-8. PMID 11239401.
{{cite magazine}}
: Check|doi=
value (yordam)CS1 maint: date format () - ↑ „Multiplicity reactivation of reovirus particles after exposure to ultraviolet light“. J. Bacteriol. 92-jild, № 5. 1966-yil noyabr. 1422–9-bet. doi:10.1128/JB.92.5.1422-1429.1966. PMC 276440. PMID 5924273.
{{cite magazine}}
: sana kiritilishi kerak boʻlgan parametrga berilgan qiymatni tekshirish lozim:|date=
(yordam) - ↑ Michod, R. E.; Bernstein, H.; Nedelcu, A. M. (2008). „Adaptive value of sex in microbial pathogens“. Infection, Genetics and Evolution. 8-jild, № 3. 267–285-bet. doi:10.1016/j.meegid.2008.01.002. PMID 18295550.
- ↑ Carstens, E. B. (2010-yil yanvar). „Ratification vote on taxonomic proposals to the International Committee on Taxonomy of Viruses (2009)“. Archives of Virology. 155-jild, № 1. 133–146-bet. doi:10.1007/s00705-009-0547-x. PMC 7086975. PMID 19960211.
{{cite magazine}}
: sana kiritilishi kerak boʻlgan parametrga berilgan qiymatni tekshirish lozim:|date=
(yordam) - ↑ Hill, Claire; Booth T; et al. (1999). „The structure of a cypovirus and the functional organization of dsRNA viruses“. Nature Structural Biology. 6-jild, № 6. 565–9-bet. doi:10.1038/9347. PMID 10360362.
- ↑ Knipe, David. Fields Virology. Philadelphia, Pa.: Wolters Kluwer, Lippincott Williams & Wilkins, 2006 — 1855-bet. ISBN 978-0-7817-6060-7.
- ↑ Attoui. „Template for Taxonomic Proposal to the ICTV Executive Committee To create a new SubFamily in an existing Family“. International Committee on Taxonomy of Viruses 1–9. 23-fevral 2012-yilda asl nusxadan arxivlangan. Qaraldi: 17-iyun 2022-yil.
- ↑ Acheson, Nicholas H. Fundamentals of Molecular Virology. John Wiley and Sons (2011). p.234
- ↑ Kanai, Yuta; Kobayashi, Takeshi (29-sentabr 2021-yil). „FAST Proteins: Development and Use of Reverse Genetics Systems for Reoviridae Viruses“. Annual Review of Virology. 8-jild, № 1. 515–536-bet. doi:10.1146/annurev-virology-091919-070225. ISSN 2327-056X. PMID 34586868.
{{cite magazine}}
: CS1 maint: date format () - ↑ „Reovirus: Rationale and clinical trial update“. Curr. Opin. Mol. Ther. 11-jild, № 5. 2009-yil oktabr. 532–9-bet. PMID 19806501.
{{cite magazine}}
: sana kiritilishi kerak boʻlgan parametrga berilgan qiymatni tekshirish lozim:|date=
(yordam) - ↑ Kelland, K.. „Cold virus hitches a ride to kill cancer: study“. Reuters (13-iyun 2012-yil). Qaraldi: 17-iyun 2012-yil.
- ↑ 21,0 21,1 Babiker, H.M.; Riaz, I.B.; Husnain, M.; Borad, M.J. (2017-yil fevral). „Oncolytic virotherapy including Rigvir and standard therapies in malignant melanoma“. Oncolytic Virotherapy. 6-jild. Dovepress, New Zealand NLM. 11–18-bet. doi:10.2147/OV.S100072. ISSN 2253-1572. PMC 5308590. PMID 28224120. 101629828.
{{cite magazine}}
: sana kiritilishi kerak boʻlgan parametrga berilgan qiymatni tekshirish lozim:|date=
(yordam) - ↑ „Oncolytic viral therapy using reovirus“, Gene Therapy of Cancer, Methods in Molecular Biology, 2009 — 607–34-bet. DOI:10.1007/978-1-59745-561-9_31. ISBN 978-1-934115-85-5.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC276440
2.https://en.m.wikipedia.org/wiki/Reoviridae#cite_ref-Gugliemi_2-1 3.https://doi.org/10.1016%2FS0092-8674%2801%2900231-8 4. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC276440 5. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5506690
Havolalar
[tahrir | manbasini tahrirlash]- ICTV: Reoviridae
- O'simlik viruslari tavsifi: Reoviridae (Wayback Machine saytida 17-iyul 2010-yil sanasida arxivlangan)
- ViPR: Reoviridae