NEDD9

Vikipediya, ochiq ensiklopediya

Rivojlanish yoʻli bilan regulyatsiya qilingan 9-protein (NEDD-9) ifodalangan nerv kashshof hujayrasi odamlarda NEDD9 geni tomonidan kodlangan oqsildir[1]. NEDD-9, shuningdek, filamentatsiya 1 (EF1), CRK bilan bogʻliq substrat bilan bogʻliq protein (CAS-L) va Cas iskala oqsili oilasi aʼzosi 2 (CASS2) ni kuchaytiruvchisi sifatida ham tanilgan. Ushbu genning muhim paralogi BCAR1 hisoblanadi.

Kashfiyoti[tahrir | manbasini tahrirlash]

1992-yilda Kumar va boshqalar birinchi boʻlib NEDD9 3' tarjima qilinmagan hududiga mos keladigan ketma-ketlik tegini asosan embrion, lekin kattalar emas sichqonlar miyasida ifodalangan genlar guruhini klonlash asosida, neyron deb atalgan genlar guruhini tasvirlab berdilar. prekursor hujayrasi ifodalangan, rivojlanishi pastga qarab tartibga solingan[2]. 1996-yilda ikkita guruh NEDD9 genining toʻliq ketma-ketligini mustaqil ravishda tasvirlab berdi va NEDD9 oqsilining dastlabki funktsional tahlilini taqdim etdi. Qonun va boshqalar. S. cerevisiae da inson cDNK kutubxonasini haddan tashqari ifodaladi va bir vaqtning oʻzida hujayra siklini va hujayra polaritesini boshqarishga taʼsir qiluvchi, filamentli xamirturush kurtaklari fenotipini qoʻzgʻatuvchi genlarni tekshirdi va shu tariqa HEF1 oqsilini (Human Enhancer of Filamentation 1) aniqladi[3]. Ushbu tadqiqot HEF1/NEDD9 ni integrin signalizatsiyasiga ulab, fokal adezyon kinaz (FAK) uchun interfaol hamkor sifatida aniqladi. Alohida, Minegishi va boshqalar. T hujayralarida b1-integrinlarni bogʻlashdan soʻng giperfosforillangan proteinni kodlaydigan genni klonladi va T hujayralarining kostimulyatsiyasi jarayonida rol oʻynashi taxmin qilinib, bu genni Cas-L (Crk bilan bogʻliq substrat bilan bogʻliq protein, limfotsitlar turi) belgiladi[4].

Gen[tahrir | manbasini tahrirlash]

NEDD9 genining genomik koordinatalari GRCh37 assambleyasida 6:11,183,530-11,382,580 yoki GRCh38 yigʻilishida 6:11,183,298-11,382,348. Gen minus ipda joylashgan. Sitogenetik joylashuvi Inson Genomi Tashkiloti (HUGO) gen nomenklaturasi qoʻmitasi (HGNC) tomonidan ishlab chiqilgan nomenklaturaga asoslangan 6p25-p24. NEDD9 HGNC tomonidan tasdiqlangan belgidir. Rasmiy identifikatorlar: 7733 (HGNC), 4739 (Entrez Gene) va ENSG00000111859 (Ansambl). CAS-L, CASL, HEF1, dJ49G10.2, dJ761I2.1, CAS2, CASS2 taxallus belgilaridir. NEDD9 geni rezus maymunlari, itlar, sigirlar, sichqonlar, kalamushlar, tovuqlar, zebrafishlar va qurbaqalarda saqlanadi. Umurtqali hayvonlarda u BCAR1 (p130Cas), EFS (Sin) va CASS4 (HEPL) deb nomlanuvchi boshqa paralog genlar bilan 4-gen oilasining aʼzosi hisoblanadi.

NEDD9 promouterida 2 ta transkripsiyani boshlash joyi mavjud. NM_006403.3 va NM_001142393.1 transkript variantlari aniq N-terminallarga ega (mos ravishda MKYK va MWTR) oqsillarni kodlaydi. Sichqonchada ikkita muqobil birinchi ekzon MKYK va MWAR hisoblanadi. Ularning vazifasi nomaʼlum. NM_001142393 NM_006403.3 bilan solishtirganda yuqori oqimda tarjimani boshlaydi, lekin ikkala transkriptda ham 7 ta ekzon mavjud. Turli tadqiqotlarda etishmayotgan ekzonlar yoki muqobil 3' terminal eksoni boʻlgan qisqaroq transkriptlar aniqlangan, ammo ularning hujayradagi roli aniq emas.

NEDD9 promouterining 5' hududi toʻliq trans-retinoik kislota (ATRA) tomonidan tartibga solinadi va retinoid X retseptorlari (RXR) / retinoik kislota retseptorlari (RAR) geterodimeri bilan maxsus bogʻlangan retinoik kislota javob elementini (NODIR) oʻz ichiga oladi[5][6][7]. NEDD9, shuningdek, aril uglevodorod retseptorlari (AhR) orqali tartibga solishga asoslangan atrof-muhitni ifloslantiruvchi dioksin tomonidan qoʻzgʻatiladi[8]. Bir tadqiqot SAFB1 korepressorining ulanishi asosida NEDD9 estrogen tomonidan bostirilganligini aniqladi[9]. NEDD9 promotor mintaqadagi T-hujayra omili (TCF) omillari bilan bogʻlanishiga asoslangan yoʻgʻon ichak saratonida Wnt signalizatsiyasi bilan qoʻzgʻatiladi[10]. NEDD9 gipoksiya sabab boʻlgan omil (HIF) transkripsiya omillarining NEDD9 promouteriga bogʻlanishiga asoslangan gipoksiya va VHL yoʻqolishi bilan qoʻzgʻatiladi[11][12][13]. Prostaglandin E2 NEDD9 transkripsiyasini keltirib chiqaradi[14]. Fox transkripsiya omili Forkhead box C1 (FoxC1)[15] va PAX5 transkripsiya omili[16] NEDD9 transkripsiyasini keltirib chiqarishi haqida xabar berilgan. TGF-beta NEDD9 transkripsiyasini keltirib chiqaradi[17] Ketma-ketlikni tekshirish asosida NEDD9 promouterida STAT5A va NF-kappa B kabi bir qator qoʻshimcha transkripsiya omillari uchun potentsial bogʻlanish joylari mavjud.

Tuzilishi[tahrir | manbasini tahrirlash]

Odamlarda NEDD9 uzunligi 834 aminokislotadan iborat. NEDD9 — katalitik boʻlmagan iskala oqsili boʻlib, u bir nechta signal uzatish yoʻllarida ishtirok etadigan, hujayra signalizatsiya kaskadlarining kattaligi va davomiyligini tartibga soluvchi oqsillar uchun joylashish joylarini oʻz ichiga oladi[18][19][20][21] NEDD9 ning umumiy tuzilishi 1-rasmda grafik tarzda tasvirlangan.

NEDD9 tuzilishi

Funksiya[tahrir | manbasini tahrirlash]

NEDD9 vositachiligida signalizatsiya

NEDD9 hujayrali proliferatsiya, omon qolish, migratsiya va boshqalar jarayonlariga tegishli bir qator muhim signalizatsiya yoʻllarining oraliq qismidir (oʻngdagi rasmga qarang)[18][19][20].

Manbalar[tahrir | manbasini tahrirlash]

  1. ↑ „Entrez Gene: NEDD9 neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 9“.
  2. ↑ „Identification of a set of genes with developmentally down-regulated expression in the mouse brain“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 185-jild, № 3. 1992. 1155–61-bet. doi:10.1016/0006-291x(92)91747-e. PMID 1378265.
  3. ↑ „Human enhancer of filamentation 1, a novel p130cas-like docking protein, associates with focal adhesion kinase and induces pseudohyphal growth in Saccharomyces cerevisiae“. Mol. Cell. Biol. 16-jild, № 7. 1996. 3327–37-bet. doi:10.1128/mcb.16.7.3327. PMC 231327. PMID 8668148.
  4. ↑ „Structure and function of Cas-L, a 105-kD Crk-associated substrate-related protein that is involved in beta 1 integrin-mediated signaling in lymphocytes“. J. Exp. Med. 184-jild, № 4. 1996. 1365–75-bet. doi:10.1084/jem.184.4.1365. PMC 2192828. PMID 8879209.
  5. ↑ „All-trans retinoic acid-responsive genes identified in the human SH-SY5Y neuroblastoma cell line and their regulated expression in the nervous system of early embryos“. Biol. Chem. 385-jild, № 7. 2004. 605–14-bet. doi:10.1515/BC.2004.075. PMID 15318809.
  6. ↑ „Crk-associated substrate (Cas) family member, NEDD9, is regulated in human neuroblastoma cells and in the embryonic hindbrain by all-trans retinoic acid“. Dev. Dyn. 231-jild, № 3. 2004. 564–75-bet. doi:10.1002/dvdy.20159. PMID 15376324.
  7. ↑ „A complex RARE is required for the majority of Nedd9 embryonic expression“. Transgenic Res. 24-jild, № 1. 2015. 123–34-bet. doi:10.1007/s11248-014-9825-9. PMC 4274375. PMID 25120220.
  8. ↑ „Nedd9/Hef1/Cas-L mediates the effects of environmental pollutants on cell migration and plasticity“. Oncogene. 28-jild, № 41. 2009. 3642–51-bet. doi:10.1038/onc.2009.224. PMID 19648964.
  9. ↑ „SAFB1 mediates repression of immune regulators and apoptotic genes in breast cancer cells“. J. Biol. Chem. 285-jild, № 6. 2010. 3608–16-bet. doi:10.1074/jbc.M109.066431. PMC 2823501. PMID 19901029.
  10. ↑ „HEF1, a novel target of Wnt signaling, promotes colonic cell migration and cancer progression“. Oncogene. 30-jild, № 23. 2011. 2633–43-bet. doi:10.1038/onc.2010.632. PMC 3164309. PMID 21317929.
  11. ↑ „Human enhancer of filamentation 1 Is a mediator of hypoxia-inducible factor-1alpha-mediated migration in colorectal carcinoma cells“. Cancer Res. 70-jild, № 10. 2010. 4054–63-bet. doi:10.1158/0008-5472.CAN-09-2110. PMC 2871069. PMID 20442290.
  12. ↑ „Transcriptional profiling of human cord blood CD133+ and cultured bone marrow mesenchymal stem cells in response to hypoxia“. Stem Cells. 25-jild, № 4. 2007. 1003–12-bet. doi:10.1634/stemcells.2006-0398. PMID 17185612.
  13. ↑ „VHL inactivation induces HEF1 and Aurora kinase A“. J. Am. Soc. Nephrol. 21-jild, № 12. 2010. 2041–6-bet. doi:10.1681/ASN.2010040345. PMC 3014016. PMID 20864688.
  14. ↑ „HEF1 is a crucial mediator of the proliferative effects of prostaglandin E(2) on colon cancer cells“. Cancer Res. 70-jild, № 2. 2010. 824–31-bet. doi:10.1158/0008-5472.CAN-09-2105. PMC 2943830. PMID 20068165.
  15. ↑ „Overexpression of forkhead box C1 promotes tumor metastasis and indicates poor prognosis in hepatocellular carcinoma“. Hepatology. 57-jild, № 2. 2013. 610–24-bet. doi:10.1002/hep.26029. PMID 22911555.
  16. ↑ „The transcription factor PAX5 regulates its target genes by recruiting chromatin-modifying proteins in committed B cells“. EMBO J. 30-jild, № 12. 2011. 2388–404-bet. doi:10.1038/emboj.2011.140. PMC 3116275. PMID 21552207.
  17. ↑ „Regulation of HEF1 expression and phosphorylation by TGF-beta 1 and cell adhesion“. J. Biol. Chem. 277-jild, № 42. 2002. 39599–608-bet. doi:10.1074/jbc.M202263200. PMID 12189134.
  18. ↑ 18,0 18,1 „CAS proteins in health and disease: an update“. IUBMB Life. 66-jild, № 6. 2014. 387–95-bet. doi:10.1002/iub.1282. PMC 4111207. PMID 24962474.
  19. ↑ 19,0 19,1 „Molecular basis for HEF1/NEDD9/Cas-L action as a multifunctional co-ordinator of invasion, apoptosis and cell cycle“. Cell Biochem. Biophys. 48-jild, № 1. 2007. 54–72-bet. doi:10.1007/s12013-007-0036-3. PMC 1976382. PMID 17703068.
  20. ↑ 20,0 20,1 „CAS proteins in normal and pathological cell growth control“. Cell. Mol. Life Sci. 67-jild, № 7. 2010. 1025–48-bet. doi:10.1007/s00018-009-0213-1. PMC 2836406. PMID 19937461.
  21. ↑ „Integrin signalling adaptors: not only figurants in the cancer story“. Nat. Rev. Cancer. 10-jild, № 12. 2010. 858–70-bet. doi:10.1038/nrc2967. PMID 21102636. 
"https://uz.wikipedia.org/w/index.php?title=NEDD9&oldid=4210620" dan olindi